Бета-версия GTA: San Andreas
Многие миссию, попавшие в финальную версию, носили иной характер. Например, "Рыба в бочке" изначально была полноценной миссией, а в итоге её обрезали до заставки. Также изначально помимо перестрелки в "Бистро Святого Марка" планировалась погоня по Портленду, но от неё отказались.
От одной из заключительных миссий, "Поиск Биг Смоука", разработчики отказались перед выходом игры. В заставке СиДжей, Свит и Большой Медведь решают навестить русского гангстера, который знает где находится Биг Смоук. После избиения противник сдается и рассказывает, где скрывается предатель. Так как многоэтажный блок находится на территории Вагос, тогда следует отбить у них эту территорию. Данную миссию планировали сделать следующей после "Лос Десперадос".Некий TheD199434 в своём канале на сервисе YouTube разместил серию роликов, в которых изображаются пять удалённых из оригинала игры миссии. Многие из них были убраны по причине несовпадения звуковой дорожки и анимации в заставке или же из-за испорченностей другого характера.
После гонки лаурейдров Цезарь звонит Карлу и предлагает подъехать к нему домой, что бы выпить пива. Во время разговора машину СиДжея конфискуют (отсюда и название миссии - "Конфискация"). Потому приходится ехать в полицейский участок, спускаться в подземную парковку и забирать свой автомобиль. Автор ролика явный любитель прорываться с боем, хотя можно было взять полицейскую машину, спокойно подъехать у нужной машине, забрать её и максимум с одной-двумя звездами преследования доехать до гаража перекраски. Следующая миссия носила название "Доберман", а та, которая носит это название в оригинале, называлась "Местная разборка". В удалённой миссии, выданной C.R.A.S.H. Тенпэнни говорит поехать к гангстеру по имени Пончо, которого должен задержать офицер Карвер. Задание состоит в том, что бы успеть приехать до задержания, собрать улики до того как это сделают полицейские и ликвидировать Пончо. По задумке миссий у Зеро должно быть четыре. Четвертой должна была быть миссия "Танки наготове". В ней Бэркли собрался уничтожить магазин Зеро с помощью пяти игрушечных танков RC Tiger, а Карл с помощью 7 машинок на дистанционном управлении, RC Bandit, должен уничтожить танчики прежде. Ничего сложного, но $5000 в кармане. Странно, что после окончания миссии появился ещё один маркер. Перед миссией "Придорожная помощь" почему-то следовало запастись дробовиком, хотя оружие в данной миссии не потребуется. Сначала едем к буксировщику, который опять же почему-то стоит на переезде. Цель - отбуксировать привязанный Sultan в гараж, а задание - не дать полицейским (две звезды розыска) "оторвать" машину от троса. Ещё $5000 было бы, если бы играли в бета-версию. Ну и напоследок, ещё одна удалённая миссия - "Правда здесь". Суть задания состоит в том, что бы вытянуть Truth из засады. Что касается побочных миссий, то задание по доставке пиццы было убрано, а авто- и мотошколы изначально находились в одном здании.Некоторые изменения касались приятных, хоть и мелочей. Если бы Карл убил пешехода, то на место преступления приехал бы микроавтобус с телевизионщиками. Магазин пончиков изначально функционировал, и там можно было поесть. Были исключены также магазины инструментов, где можно было купить молоток, отвертку и т.д. Деревни вокруг лодочной школы не существовало вовсе. В заливе Сан Фиерро был остров, прототипом которого был, скорее всего, Алькатрас.
Из оригинала был убран скейтборд, который использовался не только как средство передвижения, но и как оружие. Скейтборд должен был быть представлен в миссии "Рифмы Мэдд Догга".СиДжей на скейтборде.
И ещё немало вещей и возможностей было либо удалено, либо сокращено. Это и возможность пить пиво, употреблять наркотики, и исчезновение сельской живности, а также многое-многое другое. Например, система угона автомобиля: изначально планировалось разбивать стекло, а затем копаться с проводами. Такая система появилась позже в GTA 4, а из San Andreas убрана из-за ограниченных возможностей PS2. Второй причиной сокращений стал факт того, что вместо двух DVD, как получилось сначала, игру следовало поместить на один.